武艺篇 | 新版PubMed使用教程

一、Pubmed 更 新

PubMed以前更新一段时间了，今天带各位重新了解下利用本事。

01 广撒网，多捞鱼

在科研课题决定之初，使用Pubmed举行富裕的文献调研早已是一件家常便饭的事变，但是让人头疼是，在搜刮紧张词后，跳出的后果大多不是本人想要的剧情，很多与紧张词不婚配的文章充溢此中，无疑加大了研讨者文献挑选的事情量。 举个栗子，掀开Pubmed网页之后，在检索框中，输入Inflammatory bowel disease TNF后，点击“Search”或按Enter键，后果如下图所示。

显然，关于输入Pubmed的多词词组，它会查询词组索引，假如查到相应词组会将其作为一个检索词来检索，但假如没有查到相应词组，则会将其拆分红单个词分散检索。以是Inflammatory bowel disease TNF就相当于Inflammatory AND bowel AND disease AND TNF。

假如不想把词组分开咋办？办法很简便，四个锦囊奇策送给你：

1）加双引号：“Inflammatory bowel disease”TNF；

2）加标段标识[tw]：Inflammatory bowel disease[tw] TNF；

3）加短横线：
Inflammatory-bowel-disease TNF；

4）加截词符*：Inflammatory bowel disease* TNF

02 MeSH查缺补漏

但是成绩又来了，Inflammatory bowel disease另有一种缩略写法IBD，外表的搜刮办法无疑会脱漏一些文献，并且另有一些紧张词还会有很多同义词，不是一次性搜刮就会全部显现的。此时，Pubmed里的一款总结同义词的利器——MeSH霸气上线了。

以liver cancer lncRNA为例，在MeSH里输入liver cancer，就会跳出主题词liver Neoplasms，这名词看上去可就个高上多了。

点击第一个主题词liver Neoplasms后，可寻觅相应的副题词并举行打钩后，点击右方上的“Add to Search builder”加到你的紧张词构建（PubMed Search Builder）中。如此第一条紧张词就是“肝肿瘤的遗传学分析”

然后不要退去，持续输入紧张词lncRNA，也经过“Addto Search builder”加到紧张词构建中，这个时分必要注意的是，用“And”这种逻辑言语的话，就代表求交集了，固然还可以自主换别的逻辑言语。构建完你的紧张词之后，点击了“SearchPubMed”就OK了。

03 准确检索文章

固然你要是有所针对的或特异性的搜刮具体作者、杂志大概其他信息等，还可以举行愈加高等的检索，点Advanced就可以了！

进入之后是个这个界面，检索之后的步调就是一样的了：

又大概，在Pubmed的主页面中，点击Pubmed Tools中的Single Citation Matcher，进入以下界面，输入特定的杂志、日期、作者名字（第一作者或通讯作者）即可靶向某篇特定的文章。

04 获取全文攻略

Pubmed是择要数据库，其本身并不提供文献全文办事。关于检索到的文献，若检索后果列表中体现的PMC Full text 图标的文章。这类文章可以直接到PMC 中去阅读网页版的全文，大概在网页版全文阅读页面找到PDF 下载链接举行下载。

别的，LinkOut-more resources这里也可以链接到数据库，若数据库中的有全文链接，也可直接点击PDF举行下载。

05 临床研讨文献检索

寻常，Pubmed检索出的全体后果是未经分类，研讨者需自行阅读分类或使用filter（滤器）自行挑选。因此，若想查察具有针对性的临床研讨文章，也需破费多量的时间和精力。但是Pubmed主页里Pubmed Tools中的Clinical Queries可让研讨者笨重快捷的找到干系文献。

点击后，可进入以下界面，此中包含了三大板块：Clinical Study Categories（可选择病因、诊断、医治、预后和临床猜测指南等）、Systematic Reviews和Medical Genetics（临床遗传学）。

选择右下的see all，回到PubMed主页。输入你的二级紧张词：TNF，点击搜刮文章即可。

06 追踪最新文献

起首sign in to NCBI，即登岸“My NCBI”，没有的小伙伴可以注册一下。其次在搜刮框中输入breast cancer，点击Search按钮后在新界面中点击Create alert。

在新的界面中，依据本人的研讨抢手来设置推送的文章内容,设置完成后点击save即可。

点击相应的地点，还可修正、删除原有设置。

07 英文期刊查询

当已知某篇英文文章时，以《Surgical treatment of pulmonary tuberculosis:the phoenix of thoracic surgery》为例，可在Pubmed中检索出该文章后，点击杂志称呼J Thorac Dis，此时会跳出主动选择框，点击选择“Search in NLM Catalog”，即可进入杂志信息页面。

08 文献导入Endnote

在Pubmed数据库实行检索后，取得的信息通常是乱七八糟的，为了便利文献筛查，将文献目次导入Endnote是一个精良的选择。底下具体先容下文献导入Endnote的具体利用。8.1 导出PubMed格式文件

在Pubmed检索后果页面点击“Save”，Selection中选择必要导出的文献，Format内选择Pubmed，点击Create file天生pubmed-AspirinMes-set.txt文件，见下图。

8.2 导入EndNote

创建一个新的Endnote或在已有的Endnote中，点击File-Import-file（或点击import快捷键，见图1），choose刚刚下载的pubmed-AspirinMes-se.txt，Import Option内选择「PunMed (NLM)」。假如没有，可以掀开下拉框，选择Other Filters…，点击Import即可将检索后果导入Endnote。

09 参考文献引用

新版PubMed可直接天生引文格式，可以直接复制，很浪费时间。

10 Scholarscope插件

该插件可以体现文献的所属期刊的影响因子、期刊分区、文献典范，提供分外的全文下载途径、扫码分享文献等。

二、魔 改 PubMed

多机构对pubmed数据库举行二次定制，从而诞生了很多不同的网站（数据泉源于Pubmed），用于文献分析，这里主要先容了4大文献检索、分析网站：GoPubmed、PubReminer、GeenMedical、Pubmedplus。

01 GoPubmed

https://www.bionity.com/en/encyclopedia/GoPubMed.html

这是我第一次交往pubmed定制的网站，事先刚刚开启检索数据库的大门，对很多检索知识还知之甚少。每一次检索pubmed官网的时分，都能检索出成百上千篇文献，但是，面临云云冗杂的文献，却不知从何入手，不晓得该先阅读哪些文献。偶尔一次机会，让我遇见了Gopubmed，仿佛在断桥遇见白娘子，好生喜好。

不外，GoPubmed也有不敷的场合，每一次检索，只能检索出10万篇文献量。但是，寻常我们假如对某一研讨朝向举行检索，精炼检索式，不会检索出10万篇文献。

Gopubmed的侧边栏做得不错，可以依据期刊、出书商、研讨主题举行细分。

02 PubReminer

http://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi

PubReminer一次最多检索出25000篇文献，相较于GoPubmed更少，并且，在二次分析时相反也有”年代、作者、期刊“这几大类，但是，其独占的”Word、Mesh、Substances“却尚有一番神韵，可以与GoPubmed相反相成。

03 GreenMedical

http://www.geenmedical.com/

GreenMedical和Pubmedplus是近几年刚刚提高起来的，检索时也十分的便利。可以经过影响因子对检索的文献举行二次分析，检索的后果，也能导出题录，并且可以无偿下载大局部文献。文献下载的内核基于SCI-HUB(关于Sci-Hub这里就不先容了各位可以自行百度)，以是，文献下载的量以前十分大了，可以满意平常文献下载阅读需求。

04 Pubmedplus

http://pubmedplus.com/#/index

Pubmedplus，相较于GreenMedical，虽不克不及对检索的文献举行二次影响因子分析，但是，在每一篇文献下方，都体现了文献的影响因子，因此，可以和GreenMedical互补，固然，关于大局部文献也是可以举行无偿下载的，内核也是基于Sci-Hub的。

以上先容了基于pubmed数据库的几大检索网站，可以便利各位平常的检索，也便利各位论文的下载。不外，做研讨，最紧张的是要阅读文献，这一系列检索办法，都是为终极的文献阅读做铺垫，以是，照旧渴望各位平常多多阅读，才干提高本人的文献修养。

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本文转载自解螺旋精选