有了它，做分子生物学实行就简便多了

克日，中国封建院北京基因组研讨所生命与康健大数据中央开发了国际上首个及时定量PCR内参基因知识库——ICG（http://icg.big.ac.cn）。该知识库基于群体审编战略，对经分子生物学实行伎俩判定出的内参基因及其使用场景完成了好效的发掘、整合及正文。干系后果以“ICG: a wiki-driven knowledgebaseof internal control genes for RT-qPCR normalization”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线公布。这标志着我国封建家在实行生物学知识库建立方面所取得的历程取得了国际偕行的承认。

那么及时定量PCR、内参基因这些拗口的东东毕竟是何方神圣呢？别急，且让小编从学名鼎鼎的PCR武艺谈起。

PCR（Polymerase Chain Reaction），翻译过去即“聚合酶链式反响”，它只必要经过“变性”、“退火”、“延伸”三个步调便完成了将微量的DNA分子在生物体外高效地举行扩增。听起来仿佛没什么繁复的，但是正是这项简便的武艺为古代分子生物学的提高奠基了基本。 正如《PCR之歌》中所形貌的场景：“当你想检测遗传渐变时，来吧整个PCR；当你想要重组基因时，来吧整个PCR；当你想搞清晰孩儿他爹是谁时，来吧整个PCR；当你想要侦破悬疑大案时，来吧整个PCR……”。

《PCR之歌》截屏

及时定量PCR武艺是PCR 的奢华晋级版，它不仅可以对目标基因举行扩增，还能对其表达量完成定量分析。与传统的基因表达量测定办法比拟，该武艺具有敏捷度高、特异性强、检测范围广等优点，因此比年来被广泛地使用于形式生物及非形式生物的基因表达干系研讨中。但是云云强壮的武艺却有一个软肋——必要依托于切合的内参基因来对其后果举行标准化分析。所谓的内参基因可以简便地域解成安定表达的基因，它们在不同构造、不同发育时期或不同实行处理条件下表达水平不克不及存在明显差别。但是想找到如此的基因却绝非易事，必要依托于准确的实行计划及一系列严谨的算法分析，这关于生物学家们来说屡屡耗时耗力。假如可以富裕地发掘并整合海量文献中以前报道过的名贵内参基因资源，就能制止“反复造轮子”，进而大大地提高生物学家们的实行听从并节流开支。正是基于这个假想，内参基因知识库（ICG，Internal Control Genes）诞生啦！

ICG知识库中迩来更新的物种

作为生命与康健大数据中央的又一力作，ICG现在共收录了来自209个物种中以前被验证过的内参基因，触及了73种生物，115莳植物，12种真菌及9种细菌。该知识库提供了丰厚的及时定量PCR内参基因的干系信息，如引物序列、扩增长度、使用场景、退火温度、荧光染料、评预算法，及该内参基因在论文中的被引用情况等，以协助分子生物学家们针对其各自的实行目标来定制出愈加公道的标准化分析战略。别的，ICG不仅为卵白质编码基因的表达形式研讨提供及时定量PCR的标准化分析方案，也眷注于非编码RNA（如miRNA和circular RNA）的表达研讨。

ICG知识库中的特征词条

一方面ICG引入维基体系，在海量生物数据急速增长的背景下将极大地提高生命封建审编职员对数据搜集、整合及共享的听从；另一方面，ICG为用户们提供了机动的数据查询办法、友好的知识展现界面及无偿的数据下载办事。生命与康健大数据中央的生物信息学家们将会在每年定期地对ICG举行更新，以希冀可以不休地提供关于及时定量PCR内参基因最新的干系信息，终极目标是构建出一部细致的百科全书，不仅能纪录形式生物，并且能纪录非形式生物中及时定量PCR内参基因及其干系信息。

题外话

北京基因组研讨所生命与康健大数据中央现面向宽大科研圈招募生物审编志愿者，假如有小伙伴们乐意整理、发掘及分享RT-qPCR内参基因的干系知识，请发送邮件至haolili@big.ac.cn。接待小伙伴们到场我们~

还犹豫什么，为ICG打个Call吧！

干系研讨事情取得了中科院战略性先导科技专项、中科院国际大封建方案、国度科技攻关方案、国度863项目、国度天然基金项目、中科院百人方案等的帮助。